mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAACTGCCACATGATCTGA AGATCATGCTGGCAGCTTCAAC ACTAGGGTTCATGCGGCCAACAACTACTAGGTGAAACTGCCACATGATCTGATCTTTCCACAGCAAGTGAGGGAAGTTAAGATCATGCTGGCAGCTTCAACTGGTAGTGGTGCATGATGGTAGACAGAT ACTAGGGTTCATGCGGCCAACAACTACTAGGTGAAACTGCCACATGATCTGATCTTTCCACAGCAAGTGAGGGAAGTTAAGATCATGCTGGCAGCTTCAACTGGTAGTGGTGCATGATGGTAGACAGATATTGAGAAGAACAAGAACAAGTGTTCTAAAAGGTGATGATGTATATGATGATGACGAGATCGGAAATTGAAGGGAGGTTTTAACTGCTGCTTTTGCTAGCTAGGGTTTGG 3 1 5' arm Glycine_max mirnest MIR167_1 4e-29 gma-MIR167f 3e-57 -50.5 ((((....(((((((.((....((((((((.((((.((((((((((((((...((((((.((.....)).))))))...)))))))).)))))).)))).)))))))))))))))))))))........ (-50.5)