mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGGAGAAGCTATAGCGCTATATG TAAGCGTATAGCTTTTCCCCTT ATATAAATGGCTGCATAGCTAAACGGGAGAAGCTATAGCGCTATATGTCAATATTAAAATCATAAGCGTATAGCTTTTCCCCTTGGTTATGCATGCATATTCTC 1 2 5' arm Bombyx_mori mirbase 100 dme-mir-965 0.0000003 -43.22 .........(((((((((((((..(((((((((((((.((((.((((.............))))))))))))))))))))).))))))))))).))........ (-43.22)