mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGTGATGTGACGTAGTGGAA CCATTACCTCACAGTCACGT GGTTCAGGGTTGAAATGGCCATTACCTCACAGTCACGTGGTCATGATGGTACAACGTGTGATGTGACGTAGTGGAAGTCTCGACCTGGATA 5 1 3' arm Bombyx_mori mirbase 100 dme-mir-989 0.0003 -37.8 .(((((((.((((.((..(((((((.(((((..(((((.(((......).)).)))))...))))).)))))))..)).))))))))))). (-37.80)