mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAGCTCGTCTCTACAGGTATAT CTACCCTGTAGATCCGGGCTTTCG GGCACATTCGTGATCTACCCTGTAGATCCGGGCTTTCGTAAAAAACAAATCGAAAGCTCGTCTCTACAGGTATATCACGGCTGGCCCACGCCACCTTTTCTACAATTAGTCAAGAACTG 3 1 3' arm Bombyx_mori mirbase 100 bmo-mir-993a 7e-18 -46.3 (((.((..((((((.((((.((((((..((((((((((............))))))))))..)))))))))).))))))..)))))........(((..(((....)))..)))..... (-46.30)