mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACTGGGTGCGTGATGATTGT AGTCATCACACTCTCAGTTGATA TCTCTCTAATATAGTCATCACACTCTCAGTTGATATGTGTAACATTCTATCACTGGGTGCGTGATGATTGTGGTAGAGAT 2 1 3' arm Bombyx_mori mirbase 100 bmo-mir-2733a-1 2e-32 -34.9 ..((((((.((((((((((((.(.((((((.((((.(((...)))..)))))))))).).)))))))))))).)))))). (-34.90)