mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACTGGGTGCGTGATGATTGT AGTCATCATACTCACAGTTGATA TAACATTCTATCACTGGGTGCGTGATGATTGTGGTAGAGATTTTCACATAACGCCACCATCACATGTGACATCTCTCCTGTCTCTCTGTAATGCAGTCATCATACTCACAGTTGATATGTTTGACATTC 4 1 5' arm Bombyx_mori mirbase 100 bmo-mir-2733a-3 1e-22 -34.47 ...((..(((((((((.(.(..((((((((((((.((((((..((((((..............)))))).))))))))..............))))))))))..).).))).))))).)..))...... (-34.47)