mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACTGGGAATGTAATAGCTAT AGTTATCACTTCCTCAGTCGACA ACTGTCTACAACAATGTCTCTCAACAATAGTTATCACTTCCTCAGTCGACATGTTTTCACATTCTGTCACTGGGAATGTAATAGCTATTCTGGATAGA 1 3 3' arm Bombyx_mori mirbase 100 bmo-mir-2733e-2 0.000000000001 -27.3 .(((((((......((.....))..(((((((((.((((((.((((.(((((((....)))...)))))))))))).)).))))))))).))))))). (-27.30)