mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAAAGTTAGAGAAGTTTTAA CGAACTTCTCTAACTTTGACC TTCCTCCATTCCAAATGTTAGGTCACTTTAGCTGTGTTGAGTCGAACTTCTCTAACTTTGACCACATTTATAATGGAATGCACCAATATCTACAACATTAAATTCTTCATAAATTATGTCCTGATATAGCATTTATTTGAACATGTAGATGCCAATATATTTTTTTATAGACTTGGTCAAAGTTAGAGAAGTTTTAACTTCGAAAAGATAAAGTGAAATATAATTTGGAACAGAGT CCGGNATTCACCGCTCGACCCAGCGTCCGAGAAGATCTATTCATGTTTTTCTAATTTCTAGTATGGTCGATTAATTATTATTTCCTCCATTCCAAATGTTAGGTCACTTTAGCTGTGTTGAGTCGAACTTCTCTAACTTTGACCACATTTATAATGGAATGCACCAATATCTACAACATTAAATTCTTCATAAATTATGTCCTGATATAGCATTTATTTGAACATGTAGATGCCAATATATTTTTTTATAGACTTGGTCAAAGTTAGAGAAGTTTTAACTTCGAAAAGATAAAGTGAAATATAATTTGGAACAGAGTAGCAGATTGTTAGTTTGACTGATAGAGAAATGGTCTAGTGTTCTGCCTCAGTGAGGTGTACTGTGATCAATTATATGAACCTAGTGATTTTGCCAGCCTTTTCTGGAGCAGCAGGTTTGCAGCTTTTCATTGTGCTTGGTGGTAACTGGCAATTATCAGGGTCACCAACTCCTACATTGCTAGGATGGGATCAAACTGCTGAAAGATCATATGCTACTGCTCACCATTTGCATGCTGCTGTTGCGGAGCTGCTATTTGGTGTAAATAATTTAAATGTTTAGTCAATTGGTAACACTTCGGTTCATCTCTGCTACATGTCCTTTGCGTGCCTAGTTAGCTAGGTACTTTTGCTGTGTCCTTTGTCGTACTTGGCATAAAGAAGTCCCCTGTACTGTAATTACCTTTTATGCTNGTCATGAAAAGCGAACTGATAATTGATGCTTTGTTCTTGCTGAGGTGTTGTGGGGCCTTTCATGTATTTTTTTATCAACATTGTATTGAACATTTATTTTCACTTGCATTAGTTCCAGT 3 0 3' arm Zea_mays mirnest 100 sbi-MIR437t 0.000003 -69.5 ...(((..((((((((..((..((((((((.((...(((((..(((((((((((((((((((((..(((((((.((((((......((((((((...((((((......((.((((.....)))).))......))))))...))))))))......)))))).)))))))..)))))))))))))))))))))....)))))..)).))))))))..))..))))))))..))). (-69.5)