mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACTGGGAATGTAATAGCTAT AGCTATTACTTCTCCAGAAGACA TTTGCTGGACTGTCTATAATGTCTTTCAACAATAGCTATTACTTCTCCAGAAGACATTCACATTCTGTCACTGGGAATGTAATAGCTATTTCCAAAATT 1 3 3' arm Bombyx_mori mirbase 100 bmo-mir-2733e-2 2e-51 -28.5 .(((..((((..........))))..))).(((((((((((((((.((((..((((.........)))).))))))).))))))))))))......... (-28.50)