mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTCATCATACTCTCAGTTGATA TCACTGGGTGCATGATGATCGT CTTCTATATCTCTCTCTAATGCAGTCATCATACTCTCAGTTGATATGTGTAACATTCTATCACTGGGTGCATGATGATCGTGGTAGAGAGATCATCACATCACGC 3 1 5' arm Bombyx_mori mirbase 100 bmo-mir-2851-1 2e-33 -34.1 ..........((((((((..((.((((((((.(.((((((.((((.(((...)))..)))))))))).).)))))))).))..)))))))).............. (-34.10)