mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAAAGTTAGAGAAGTATGCC CAAACTTCTCTAATTGTTGACC TTTGTGCTACCTTATGTTCCAAATTATAGTTCACGTTAGCTTTGTCCTAAGTCAAACTTCTCTAATTGTTGACCAATTTAGTAGAAAAATACACCAACATCAAACTAGTTTCTTTTATATTTTCCATGAAATGTGTTTTGACATAGCATTTAATTGAATCTGTAGATGTTATATAATTTTTTCTAAAAAACCCGTTCAAAGTTAGAGAAGTATGCCTTAGGACAAAACTAAAGTTAACTATACTTTTGGGGGTGGGGGGTAGCAA GCACGACGTAATGACTGACTGGAAGTTCACAGGGGAAATACCTCCAATGACAGACGAAGCATGGCAGCTGGAATTTGAGAAATACAAGCAGTCACCTGAGTACAAAAGGCAAGGATGCAACCGCTGACATTTATTCATACGTTACCTTACATTTGTCTGCTATTTTTTATGGTCACCAGTGTAACTAGGTAATGGCCTTATGTTAACTTTAGCTCCCATGTGCACCAAACCAGAAATCCCCATAGTTCTCACATGTGTAACCTTGACACACATTATCAGTACTTTTTTTTGAAAGTTTAGAACATTGTAATAAACAACAGTATGCAAGATCAAAGGAAAAAAAAGGAAGAATACTGTTTTGTGCTACCTTATGTTCCAAATTATAGTTCACGTTAGCTTTGTCCTAAGTCAAACTTCTCTAATTGTTGACCAATTTAGTAGAAAAATACACCAACATCAAACTAGTTTCTTTTATATTTTCCATGAAATGTGTTTTGACATAGCATTTAATTGAATCTGTAGATGTTATATAATTTTTTCTAAAAAACCCGTTCAAAGTTAGAGAAGTATGCCTTAGGACAAAACTAAAGTTAACTATACTTTTGGGGGTGGGGGGTAGCAATTGATATGAATTTGATAGCAACATANAATATGTAGTTCACATGGACTCTCAACAACTTTGAGTACTTTCCCTTTAACAGATAAATGTTTATCCCC 2 1 3' arm Zea_mays mirnest 100 osa-MIR437 0.000000004 -75.7 ....(((((((((...(((((((.(((((((.((.((((.(((((((((((.((.((((((((((((.((((.........((((((((......((((((....(((.(((..(((........(((...(((((....))))).))).)))..))).)))..)))))).......))))))))..........)))))))))))))))).)).))))))))))).)))).)).)))))))..)))))))....))))))))). (-75.7)