mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAGATGTGGATATTATGGTGTGGAGG AACATACCATGGTCTCGTAACTA GCTGCACCTCGGGAGATGTGGATATTATGGTGTGGAGGGATAGAAACCGCGTGGCTTTAATTTCAACATACCATGGTCTCGTAACTACCAGGTGTGGC 6 3 5' arm Bombyx_mori mirbase 100 bmo-mir-2731-1 3e-19 -37.2 ((..(((((.((...(((.((((..(((((((((..(..((.(((.((....)).))).))..)..)))))))))))))))).....)))))))..)) (-37.20)