mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGCATTGTAATACACTGTTA GTAGTGTATTACAATACAAAGT TTCGGGTGTTTCATTACAGTAGTGTATTACAATACAAAGTATGAACTTTGCATTGTAATACACTGTTATATTACTTGA 2 0 3' arm Bombyx_mori mirbase 100 bmo-mir-2804-2 1e-36 -26 .(((((((......((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)))))))))))))))).)).))))))) (-26.00)