mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCAGCTGCATACAAATTTCA AAATTTGTATGAAGTTGGAACG TAAAAGTTAAGTCAAATTTGTATGAAGTTGGAACGCTTGCCTATGTTTGCCGCTAGGGGCACTGTTCCAGCTGCATACAAATTTCAGGTAACTTTT 2 0 3' arm Bombyx_mori mirbase mir-2807 1e-31 bmo-mir-2807a-2 2e-42 -39.3 .((((((((..(.(((((((((((.((((((((((..(((((..((.....))...))))).)))))))))).))))))))))).)..)))))))) (-39.30)