mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCAGCTGCATACAAATTTCA AAATTTGTATGGAGTTGGAACG AAAAGTTAAGTCAAATTTGTATGGAGTTGGAACGTTTGCCTATGTTTGCCGCTAGGGGCACTGTTCCAGCTGCATACAAATTTCAGGTAACTCTT 2 0 3' arm Bombyx_mori mirbase mir-2807 5e-34 bmo-mir-2807a-1 2e-42 -38.9 ...(((((..(.(((((((((((.((((((((((..(((((..((.....))...))))).)))))))))).))))))))))).)..)))))... (-38.90)