mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCAGCTGCATACAAATTTCA AAATTTGTATGGAGTTGGAATG AAAAGTTAAGTCAAATTTGTATGGAGTTGGAATGTTTGCCTATGTTTGCCCCGGGGGTCATTGTTCCAGCTGCATACAAATTTCAGGTAACCTTT 2 0 3' arm Bombyx_mori mirbase mir-2807 9e-48 bmo-mir-2807a-2 2e-32 -32.4 ....((((..(.(((((((((((.((((((((((...((((.((.......)).))))...)))))))))).))))))))))).)..)))).... (-32.40)