mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACAAACAAAGCATTTGTTTGA AAGCAAATGCTTTATTTGTATG GCACAGATAGTCAAGCAAATGCTTTATTTGTATGTTTCCTACATACAAACAAAGCATTTGTTTGACCATCTGTGA 1 0 3' arm Bombyx_mori mirbase 100 bmo-mir-2831-2 4e-18 -43.6 .(((((((.((((((((((((((((.(((((((((.....))))))))).)))))))))))))))).))))))). (-43.60)