mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA TGGGTGGCTTGCTTCTCCAGC GTAGACGGTGGCTGTGCGTGGTGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACCATCCAATGCCGCCGAGCTCCATCAGCTGGGTGGGTGGGTGGATGGATGGGGCTGTGGGTGGCTTGCTTCTCCAGCGCGGACGGAGTGTGTTGT ATTCGAGAATTGCGAAGCTGAGTGCAGACGTCCGATCCGATCCATGGTTCCTTTTCTGGCACTTGAGAGATGTGTGTGGTAGACGGTGGCTGTGCGTGGTGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACCATCCAATGCCGCCGAGCTCCATCAGCTGGGTGGGTGGGTGGATGGATGGGGCTGTGGGTGGCTTGCTTCTCCAGCGCGGACGGAGTGTGTTGTTTTTT 2 0 5' arm Zea_mays mirnest MIR164 2e-18 zma-MIR164b 6e-28 -62.6 ...((((....((((.((((.((((((((((((.(((.((((...(((((((...(((((..((.(((((.....))))))).))))).)))))))...)))).))).)))))))))))).)))).))))....)))).. (-62.6)