mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACTCCCTTCGTTCCAAAAT TTTGGAAGAGGAGGAGTAATA TCACAAAAAATATACTCCCTTCGTTCCAAAATATATGTCATTTTAGTTTGGTCCTAAGTCAAACATCTTTAAGTTTGACGAAGTTCAGATAAAAATATATTAACATCTAGGACATCAAATAAACTAATTTAATGTCGTCGATTTTGATGAATTTTTCTATAAACTTGGCCAAGGTTACAGAACTTTGACTAAGAAGCAAACTAAATCAAAATACATTTTGGAAGAGGAGGAGTAATACATTGTTG GCAAGGCAAATCTAAAGATGAAATGAATCGTCAAAAACTACGCTCATTAAGCAATCGAAACCCTTTCAGGGTTGGTAACTACCTGATCATCATTCTTGTCGTTGGGATCTGCAGACAAACAAAATATGTCAATGCTTACCAATTTCAGGTAAAACAATGCATTCTGATAGTGCAATGCTGTAATTCACAAAAAATATACTCCCTTCGTTCCAAAATATATGTCATTTTAGTTTGGTCCTAAGTCAAACATCTTTAAGTTTGACGAAGTTCAGATAAAAATATATTAACATCTAGGACATCAAATAAACTAATTTAATGTCGTCGATTTTGATGAATTTTTCTATAAACTTGGCCAAGGTTACAGAACTTTGACTAAGAAGCAAACTAAATCAAAATACATTTTGGAAGAGGAGGAGTAATACATTGTTGTATATAGATATACTACATTTCGGCCAACAATGGCCATGCCATGTATTATTGTTCAGCATGCTTTTAATGCTTATGACCACCTATTACACAGTTTCATTATAGTTTTGTTAGTCACTATTGTA 1 2 5' arm Zea_mays mirnest MIR1122 0.00006 sbi-MIR437v 0.00000005 -58.3 ............((((((((((.(((((((((.(((.....(((((((((.((....(((((((........))))))).(((((.(((..(((((.((((((.(((...(((((.((((......)))).)))))...))).)))))).))))))))...)))))((.(((((((....))))))).))..))..))))))))).....))).))))))))))))).))))))........... (-58.3)