mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGATCAAGTTTATAGAAAAA GTTCCTATAAATTTGGTTAAAT GTGACTACTCCCTCCCTATGTTTCATGTTATAAGTTGCTTTGATTTTTTTTCTAATCAAATTTCTTTAGATTTGATCAAGTTTATAGAAAAATATAATAATATTTTCAATACAAAATAGATATATTATCATAATATATTCAGCGTAATATTTAATAAAACTAATTTTGTGTTGTAAATGTTGCTAATTGTTCCTATAAATTTGGTTAAATCTATAGAAGTTTGACTACGAANAAAATCAAAAACAACTTATAAAATATAACACGGAGGAAGTATTAGC CCAGGACTTCAAATTGGGTAAGCCAGCAGATTACAGGCACTACTTGGTGATCTCGATCGGGACGGGAACGGCGACGATGGCGGAGAAGTACACCGCACCGGCATGCGCGAAATGGGGTGTACTCCGGTGGCTCTACGACAGCGGCTTCACCCCACTCATCGACATCTTCAGCCATGCAAGTGCAGACATGGTCGACATCCATGCCTCCGTTCTCTTCCAGTCTCTCTCCTGCGAGAAGAGCTACCTCCGCATTTAGGTGACTACCATGGTTTGAAATTTTGGTTTGAAATTTCGGCCCCCACTGGCAAGCACAAATTTCCATGAAATTTTTGGATTATTTTTCAAATATTTGTGCATTTGGTAAAAAATTTTCGAAATTCAATCAAAATATGTTCAAAATTCAAATAATTTTGGTAAAAAAAACCCGGAAATCATGAGATTTTCAAATTTTCGGCAACCACGGTGGCAACCAAAATTGCAAACCCTAGTGACTACTCCCTCCCTATGTTTCATGTTATAAGTTGCTTTGATTTTTTTTCTAATCAAATTTCTTTAGATTTGATCAAGTTTATAGAAAAATATAATAATATTTTCAATACAAAATAGATATATTATCATAATATATTCAGCGTAATATTTAATAAAACTAATTTTGTGTTGTAAATGTTGCTAATTGTTCCTATAAATTTGGTTAAATCTATAGAAGTTTGACTACGAANAAAATCAAAAACAACTTATAAAATATAACACGGAGGAAGTATTAGCTATTAAGTTGCATATGCACCCAACTATTATCGGGCTACTTGTATCATTACATTAATATACTTCTACACCAGTAAAAATAACCTAGCTACTACCGA 1 1 5' arm Zea_mays mirnest 100 sbi-MIR437d 0.0002 -80.5 .....((((.(((((...((((..((.((((((((((.(((((((((.(((.((.((((((((((.(((((((((((((((((((((((.(((.((.((((((((.(((((((((((((...(((((..(((.(((.......))).))).)))))...)).))))))))))).)))))))).))))).)).))))))))))))))))))))).)))))))))).)).))).)))))))))..)))))))))).))..)))).))))).))))..... (-80.5)