mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGAATGTCGCAGGACGTGCTGGCT TGGGCTGTTTGTTTTTTCTGCGGATCGATT GGCGAGAAACTCAGTGGGCTGTTTGTTTTTTCTGCGGATCGATTTTATGTGAGGCACCTGTTTTTTATTGACGCGTTTCCTTGGTGCTATTGTGGTTCTTCTACATGAATTCGAATGTCGCAGGACGTGCTGGCTGGGTTATCTTGTG 3 9 3' arm Bombyx_mori mirbase 100 bmo-mir-2808a-1 0.0001 -52.04 .((((((((((((((.(((....((((....((((((.((((.(((((((((((.(((.......(((..(.........)..))).......))).)))).))))))).))))...)))))))))).))).)))))))).)))))). (-52.04)