mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGAATTTTTACCCTTTTTTGGTCT ATGTAAAGCAAGGAAAAATTGAGG ATCGGTCTAATTATCTCATTAAAACATTTTTTTCGAATTTTTACCCTTTTTTGGTCTGAGGTATATCGGATGTAAAGCAAGGAAAAATTGAGGACGGTTTTCTGAAAGAGCGACCC 0 5 5' arm Bombyx_mori mirbase 100 100 -22.5 ...((((...((...(((..(((((....(((((.(((((((..(((((((((((((((......)))))).))))).))))))))))))))))..))))).)))..))..)))). (-22.50)