mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGACGTGTCATTTTTCCTATTA AACAATAACTCGGGAAGAGCTGTTGCGCTTTGAGG CTAGTTTTTAATCTTACTGCTCAGACGTGTCATTTTTCCTATTAAGGTGAAACTTGAACAATAACTCGGGAAGAGCTGTTGCGCTTTGAGGAAGGTTTATGACTT 2 11 5' arm Bombyx_mori mirbase 100 100 -23.9 ..((((...((((((....((((((((((.((((((((((.(((((......)))))..........)))))))).)).)))).)))))).))))))...)))). (-23.90)