mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGTATACCTTCAGTATACGTAAC ACGTATACTGAATGTATCCTGAG GCGTCGCCTTCTGTACGTATACTGAATGTATCCTGAGTGCGCGATTCTTGTCCGGTATACCTTCAGTATACGTAACAGAAGATGACAC 2 1 3' arm Bombyx_mori mirbase mir-iab-4 1e-43 bmo-mir-iab-4 7e-45 -37.7 ..((((.(((((((((((((((((((.((((.(((.(.(((.......))))))).)))).)))))))))))).))))))).)))).. (-37.70)