mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTGTCGCAGGAGAGATGGTG TCATCTTTCCTGGACTGAAG GTAAAGGGGCTTCTGTCGCAGGAGAGATGGTGCCTACCGCCTAGCTCTTGCTTGCTGGTTTGTGCATTAATGTCATCACAGCAATATGTAATTAAGCATCATCTTTCCTGGACTGAAGCCCATCAT CCCACGCGTCCGAAGAAGAAGAGACAATGTTCAACCTAATAAGGCATGCAAGAGAGGAGCAAAGCAATGCTAGCTGATCAGAAAGAGACGTAAAGGGGCTTCTGTCGCAGGAGAGATGGTGCCTACCGCCTAGCTCTTGCTTGCTGGTTTGTGCATTAATGTCATCACAGCAATATGTAATTAAGCATCATCTTTCCTGGACTGAAGCCCATCATTTTCTTTCAGTAGCACCATCGTTGAGAAAGAAAGAGGTACGTTTCCATTTTGTTTTGTTTTGTTTTAATCATTTTATTTATCTGTTCTATATGTTGAATTCATGCATGGTTTATAGGGACGACGATATATTAGTATTTGTTTTGTAAAGCTATCGTGAGTTAGAATTTCTGGTGTCAGTGTGATGGGGATTGAATCTCTATCAAATTAATCTGGCTTAAATTTTTATAACTCCAGTGTGTAACTACCCAGATAAATAATTTAGCAAGGAAATAAAAAGAGGATTTTTACTCCTATTCCCATCATTAGGTTGAACATTGTCTCTTCTTCTTCGGACCCGTGGGGG 1 1 5' arm Citrus_aurantium mirnest 100 100 -46.4 ......(((((((.(((.(((((((((((((((.((..((...))..((((((((((...((.(((....)))))...))))))...)))).)).)))))))))))))))))).)))))))..... (-46.4)