mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGAAGAGC TCTCAAAGTGGCTGTGAAATG AACTGTATCCACTCTCAAAGTGGCTGTGAAATGGTTCCTCCAGAAATCGCCATATCACAGCCAGCTTTGAAGAGCGATACGGTT 2 2 3' arm Culex_quinquefasciatus mirbase mir-2 2e-33 aae-mir-2a 0.00000000002 -40.82 (((((((((..((((((((((((((((((.(((((.............))))).))))))))).))))).)))).))))))))) (-40.82)