mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTATTCTAGCTGTAGA TAAAGCTTTAGTACCAGAGGTC ATGCGTATAATTTCCGGCTGAATCTTTGGTATTCTAGCTGTAGAATGTTGAGCTTGTTACGGTATCTTCTAAAGCTTTAGTACCAGAGGTCCAACTGGGAATTGCTTGCTG 3 0 5' arm Culex_quinquefasciatus mirbase 100 aae-mir-9c 1e-28 -41.6 ..(((..((((((((((.((.((((((((((((..((((.(((((.((...(((......))))).))))).))))..)))))))))))).)).))))))))))..))).. (-41.60)