mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATATTGTCCTGTCACAGCAGT TGTTGTTTCGGGACATTTACA TTTTGCTAGAAAACGATTATATTGTCCTGTCACAGCAGTACTTTTCCTTAGCTTACTGTTGTTTCGGGACATTTACATTGATTCTAGCCGTCAC 6 0 5' arm Culex_quinquefasciatus mirbase 100 aae-mir-1000-1 2e-29 -31.6 ....(((((((..((((.....(((((((..(((((((((((.......))..)))))))))..))))))).....)))).)))))))...... (-31.60)