mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGAGC TCACAAAGTGGTTGTGAAATG GCTGGGCTCACAAAGTGGTTGTGAAATGCATTTCCATTTTGCCCGCATATCACAGCCAGCTTTGATGAGCTTAGC 1 2 3' arm Drosophila_ananassae mirbase mir-2 7e-20 dme-mir-2a-1 2e-23 -38.66 ((((((((((((((((((((((((.((((...............)))).))))))))).))))).)))))))))) (-38.66)