mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAAAGCTAGACAACCATTGA TTTGGTCGTCCAGCCTTAGGTGA TTGCAATTAGTTTCTTTGGTCGTCCAGCCTTAGGTGACTTCTCTGATCATAAAGCTAGACAACCATTGAAGTTCGTTGTGG 7 2 3' arm Drosophila_ananassae mirbase 100 der-mir-4 2e-38 -22.9 (..((((.(..(((..((((.(((.(((.....(((((......).))))...))).))).))))..)))..).))))..) (-22.90)