mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCAAGATGTCGGCATAGCTGA CGCTATGCTGCATCTAGTCAGT TCTGTTGTTAAATTGGCAAGATGTCGGCATAGCTGACGTTGGAAAACGAATTTTGAGAGCGCTATGCTGCATCTAGTCAGTTGTTCAATGGA 4 1 5' arm Drosophila_ananassae mirbase mir-31 2e-27 dme-mir-31a 4e-31 -38.2 (((((((...(((((((.(((((.(((((((((...((((....)))).....(....).)))))))))))))).)))))))...))))))) (-38.20)