mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGATGCTGCTGCAGCTGCAG GCAACTTCGGCGGCTCGATG TAAATTTCTTGGGGAGCTGGCCCTCCTCATCATGATGCTGCTGCAGCTGCAGCTGCAACTTCGGCGGCTCGATGCTCATTCCCAGGGGGGTCGTGACACTTG AACAAACATAAAAAAAACCCCCAGGCTCCCCAGGTTTTGTTACCTCAATAGTTTTTACCCCACACACAAAAAAAACACAAAGCCCCCCCCGACGAGCCATAAATAATACCTGGCTGCAGGGGGGGCGACTCTACATGGCCCCCGCGGGCTGCGAGGACTAAAACGACAGCTTCCCTAAAAAAAAACACCCCCACTGACCGATGATGGGGGTTGGGGTTAAAAAAAAAACACCTCATCCCATCTCATCTTTGTCACTTCCCCATCCCCCTCTGTATCCCACCTAGAAGGGTTACCCTCCGGTTTGGGGCTGCCCCCAGCACAGTTCCCATTGCTGTTATTACTAAATTTCTTGGGGAGCTGGCCCTCCTCATCATGATGCTGCTGCAGCTGCAGCTGCAACTTCGGCGGCTCGATGCTCATTCCCAGGGGGGTCGTGACACTTGGTACCTGGGCGTCACCCCCCCCACCCAACAAACGTGAATTTTCTGCTTCCATGTCTTGACAAGCCTTCTTGAGGTTGTCAAGTTCTGCTCTGAAAGCGCTGTTCTCGGTCGTTAGGTCAGCTACCTTCCGGGCTAACTCCTCGCACTCTTGCTGCTTGCGTAATCTAGATCTCCTTG 5 1 5' arm Zea_mays mirnest mir-598 0.0003 100 -33.1 .........(((((((......)))))))...(((.(((((((.((.(((....))).)).))))))))))....((((.(((....)))..))))...... (-33.1)