mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTCCCCTTCAACCAGCTGT AGCTGGTTGACATCGGGTCAGAT TGCAACGCTGTATGTAGCTGGTTGACATCGGGTCAGATCTATCTTTTCAAGCATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGCAGTGGTTGAT 5 1 3' arm Drosophila_ananassae mirbase mir-133 3e-44 dgr-mir-133 9e-35 -35.3 ..(((((((((.(((((((((((((....((..(((((((.........)).)))))..))...)))))))))))))))))).)))).. (-35.30)