mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTCATGTCGATTTCATTTCATG CGTTGGTTTCATGTCGATTTC CATGTCGTAATTAGCAGGGCACAGAATTGCCGGCGATAATTAATGACGTTGGTCACGTTGGTTTCATGTCGATTTCATTTCATGACACGGCC 11 2 5' arm Drosophila_ananassae mirbase mir-288 1e-31 dps-mir-288 4e-40 -21.6 ...((((((((((((..((((......)))).))..))))).)))))((((((((.(.(((..((.....))..)))...).)))).)))). (-21.60)