mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGCACTTATACCGGCCTGA AGGACGGTATTTGTGTCAATATG CCAGATTATCTTCAGGACGGTATTTGTGTCAATATGGATATTTCAAACATATTGCACTTATACCGGCCTGATGATCTC 3 1 3' arm Drosophila_ananassae mirbase 100 100 -31.4 ..((((((...(((((.((((((..(((.(((((((...........))))))))))..)))))).))))))))))). (-31.40)