mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAACACAGCTGGTGGTATCCAGT TGGGATACACCCTGTGCTCGCT TGCATCGGCTGCTGGGATACACCCTGTGCTCGCTTTGAATGAAATGCAAGCAAGTGAACACAGCTGGTGGTATCCAGTGGCCGTTTTGCAT 5 2 3' arm Drosophila_ananassae mirbase mir-317 3e-35 dme-mir-317 4e-37 -43.5 ((((.((((..(((((...(((((((((.((((((.(..((.....))..))))))).)))))..))))...)))))..))))...)))). (-43.50)