mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACTGGGCAAAGTGTGTCTCA GGATGCATCTTGTGCAGTTATG GATCCTGGGATGCATCTTGTGCAGTTATGTTTCTATCTCACATCACTGGGCAAAGTGTGTCTCAAGATC 4 0 3' arm Drosophila_erecta mirbase mir-3 5e-27 dme-mir-3 3e-31 -28.7 ((((.(((((((((..((((.((((.((((.........)))).)))).))))..))))))))).)))) (-28.70)