mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAAAGCTAGACAACCATTGA TTTGGTCGTCCAGCCTTAGGTGA TTGCAATTAGTTTCTTTGGTCGTCCAGCCTTAGGTGACTTTTCTGATCATAAAGCTAGACAACCATTGAAGTTCGTTGTGG 7 2 3' arm Drosophila_erecta mirbase 100 dya-mir-4 9e-41 -22.9 (..((((.(..(((..((((.(((.(((.....(((((......).))))...))).))).))))..)))..).))))..) (-22.90)