mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCAAGATGTCGGCATAGCTGA CGCTATGCTGCATCTAGTCAGT TCCGTTGGTAAATTGGCAAGATGTCGGCATAGCTGACGTTGAAAAGCGCTTTTAAAGAGCGCTATGCTGCATCTAGTCAGTTGTTCAATGGA 4 1 5' arm Drosophila_erecta mirbase mir-31 1e-43 dme-mir-31a 2e-42 -41.3 ((((((((..(((((((.(((((.(((((((((....(((....)))((((.....)))))))))))))))))).)))))))..)))))))) (-41.30)