mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAAGCTAGATTACCAAAGCAT GCTTTGGCGCTTTAGCTGTATG AGCTGCCTTGCCATTGCTTTGGCGCTTTAGCTGTATGATAGATTTAAACTACTTCATAAAGCTAGATTACCAAAGCATTGGCTTCTGCAGAT 5 0 3' arm Drosophila_erecta mirbase mir-9 6e-24 dya-mir-79 7e-45 -37.4 ..((((...((((.((((((((...(((((((.((((((((.......)))..))))).)))))))...)))))))).))))....)))).. (-37.40)