mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTCATGTCGATTTCATTTCAGG TAATTAGCGGAGCTCGGCGTTGCC CGGTCATGTCGTAATTAGCGGAGCTCGGCGTTGCCGGCGATAATTAATGACGGTGGTCACGTTGGTTTCATGTCGATTTCATTTCAGGACACGGCCG 8 5 3' arm Drosophila_erecta mirbase mir-288 5e-37 dya-mir-288 8e-45 -32.02 (((((.((((.(........(((.(((((((.(((((((........((((....)))))))))))...))))))).))).....).)))).))))) (-32.02)