mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAATATTTAAGTGGAGCCTGCGACT TAACTCACTTGAGCGTTTGTT AGTTTACAGTAAAATAAATATTTAAGTGGAGCCTGCGACTCCAGTCCCTCTGACGGACTGGGGTAACTCACTTGAGCGTTTGTTGGCACGTAAAAG 4 5 5' arm Drosophila_erecta mirbase mir-289 8e-39 dse-mir-289 7e-45 -32.2 ..(((((.((..((((((..((((((((.((......((((((((((.......))))))))))..))))))))))..))))))...))))))).. (-32.20)