mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGCACATTCCCCAGCCTGA GGCTGTGGAGTGGGCTAGTACT CAATTTTCGGCTGTGGAGTGGGCTAGTACTGTGATTTTAACATTGAGTATTGCACATTCCCCAGCCTGAAAGTGT 2 2 3' arm Drosophila_erecta mirbase 100 der-mir-311b-2 3e-37 -29.3 ..(((((((((((.((((((.((.(((((((((.......)))..)))))))).)))))).))))).)))))).. (-29.30)