mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGAGC TCTCAAAGTGGTTGTGAAATG GCTGCGCTCTCAAAGTGGTTGTGAAATGCATTTTTGAAAGCTTTGCGCGCATATCACAGCCAGCTTTGATGAGCTTAGC 1 2 3' arm Drosophila_grimshawi mirbase mir-2 2e-29 dvi-mir-2a-1 5e-33 -34.91 ((((.(((((((((((((((((((.((((...................)))).))))))))).)))))).)))).)))) (-34.91)