mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGTGGCTGTTCTTTTT AGAGAACGCTCGCTGCTGATGTA AAGGAAGAGAACGCTCGCTGCTGATGTAGTTCATGATTCAAATATTTTATATCACAGTGGCTGTTCTTTTTTGT 0 3 3' arm Drosophila_grimshawi mirbase mir-6 2e-35 dgr-mir-6-3 1e-36 -24.63 ..((((((((((((.(((((.((((((((.................))))))))))))))).)))))))))).. (-24.63)