mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTCCCCTTCAACCAGCTGT AGCTGGTTGACATCGGGTCAGAT TACAACGCTGTATGTAGCTGGTTGACATCGGGTCAGATCTATTTATTCGAGTATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGCAGTGGTTGAT 5 1 3' arm Drosophila_grimshawi mirbase mir-133 2e-42 dan-mir-133 9e-35 -35.7 ..(((((((((.(((((((((((((....((..(((((((.........)).)))))..))...)))))))))))))))))).)))).. (-35.70)