mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGTGGGACTTTCGTCCGTTT CCGGATGACGGTTCACAACGACC TGATGGTACGGTGCGACCGGATGACGGTTCACAACGACCGTGCTTATTTTTAACTGGTCGGTGGGACTTTCGTCCGTTTGTAACGCCATTTG 3 1 3' arm Drosophila_grimshawi mirbase mir-278 1e-37 dvi-mir-278 3e-38 -37.2 .((((((....(((((.(((((((.(((((.((.((((((.(.(((....)))))))))).))))))).))))))).)))))..)))))).. (-37.20)