mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACTAGATCCACACTCATTAA AGTGGGTGAGGGTCCAGTGTTTCACA GTATTACTGTTTTTAGTGGGTGAGGGTCCAGTGTTTCACATTGTTTATTTGTATTTGTGACTAGATCCACACTCATTAAAAACGGTAGTTC 2 4 3' arm Drosophila_grimshawi mirbase mir-279 6e-27 dan-mir-279 2e-32 -35.96 ..((((((((((((((((((((.(((((.((....(((((...............))))))).))))).)))))))))))))))))))).. (-35.96)