mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTG GGCAGTCTCCTTGGCTAGC TACAGAGCAGGAGAGGAGGGGCCTCGCATGGCGATGAGAGCACTGCTCTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGGCCTCCATCAGTCGCAGAGGACGCTGTTCTTCTGCTTGTGGTTGTCGATCGCAGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCCGAGCGGCTCTCATCCACCATGCCAGGCTCGTCTCTTCTATTTCTTC AACCATCGACCAGCCCCCAATCGGGAAAGTTTTAGATCAGAACCGTCAGAGTAACTCCTAGCATGGTTCTGTACAGAGCAGGAGAGGAGGGGCCTCGCATGGCGATGAGAGCACTGCTCTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGGCCTCCATCAGTCGCAGAGGACGCTGTTCTTCTGCTTGTGGTTGTCGATCGCAGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCCGAGCGGCTCTCATCCACCATGCCAGGCTCGTCTCTTCTATTTCTTCAACCCGACTCGTTCACGCCGCCAGAACGAAGGGAAACGGGGAACGAACACGCGAAGGGTGCAGATGACAGGACGACGATGGTCAGAGACCAATTCATGAGTTTGACGGCACTTATTTGCCCCTCCTCCCCCTGTTCATTTATTTCTTGCTGCTTCAGAGCACAGAGTGAAGCTAGAGAGAGGTGGCTATGCAATGGAATGATACTTCCTTTAGTTAGAGCTTTCTTACGTACGATCCTCCGGCAGATGC 0 2 5' arm Zea_mays mirnest MIR169_5 4e-70 zma-MIR169k 2e-71 -97.7 ...((((.((((((((..((((((.((((((.(((((((((...((((.((((((((((((.((((.((((((((...(((.(((..((((((((......)))))))))))))).......)))))))))))))))))))))).)).)))).)))))))))..)))))).)))))).))))))))..)))).. (-97.7)