mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATCTCAATTTGTAAATGTGAG CTCACTTTGCAATTGGAGATTGCT GCAGCATTGAATAATCTCAATTTGTAAATGTGAGCGATTATTAAGAATTTGACGCACTCACTTTGCAATTGGAGATTGCTCGAGATTGC 3 3 5' arm Drosophila_grimshawi mirbase mir-304 3e-32 dvi-mir-304 6e-36 -28.4 ((((..((((.(((((((...(((((((.(((((((.(((.........))))))..)))))))))))...))))))).))))..)))) (-28.40)